DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶（mtase）催化下，在DNA的腺嘌呤或胞嘧啶碱基上加上一个甲基，是研究最多的细菌DNA复制后修饰机制之一。目前已鉴定的三种核苷酸甲基化形式是：N6-甲基腺嘌呤（m6A）、N4-甲基胞嘧啶（m4C）和5-甲基胞嘧啶（m5C）。 DNA甲基化，一种表观遗传修饰，抑制基因表达。DNA甲基化主要是由一个DNA甲基转移酶家族（DNMTs）引起的，包括DNMT1、DNMT3a和DNMT3b。通常，DNMT1作为主要的维持甲基转移酶，以保持基因组中已经建立的DNA甲基化，而DNMT3a和DNMT3b被分类为从头甲基转移酶，以可逆地甲基化未甲基化的DNA。DNA甲基化通过几种机制抑制基因转录，包括物理上阻断转录因子的结合和/或作为转录抑制因子/共加压因子的对接位点。 在表观遗传转录调控中，DNA甲基化模式是由DNA甲基转移酶Dnmt3a和Dnmt3b在胚胎中的从头甲基化决定的。 CpGdinucleotides基因启动子区胞嘧啶的DNA甲基化与沉默基因表达有关。在DNA甲基转移酶中，只有DNA甲基转移酶3a（DNMT3a）和3b（DNMT3b）能够添加新的CpG甲基化标记，从而可以动态调节基因沉默。