琼脂糖凝胶电泳常见问题与解决办法
Release Time:2020-07-07一、琼脂糖凝胶电泳简单介绍:
琼脂糖凝胶是以琼脂糖为支持介质制备的凝胶。琼脂糖分为一般琼脂糖和经化学修饰后熔点降低的低熔点琼脂 糖,琼脂糖的熔点在62?65°C之间,融化后在37°C下可维持液态数小时,30°C时凝固成胶。多用于对染色体DNA在凝胶内进行原位酶切及DNA片段回收。琼脂糖凝胶 由于孔径大常用于大分子蛋白质、DNA的分离。
二、琼脂糖凝胶电泳凝胶制备
序列 | 产品名称 | 货号 | CAS | 备注 |
1 | 琼脂糖 | SF0012 | 9012-36-6 |
(1)总液体体积不得超过三角烧瓶体积的50%。
(2)将2%或更多的胶水溶液设置为中火。
(3)当胶液剧烈沸腾时,停止加热,取下三角瓶,请戴上耐热手套,小心摇动三角瓶,然后再次加热,胶会沸腾直至胶变透明,确保琼脂糖完全溶解了
2.琼脂糖电泳图像的背景模糊:如果琼脂糖没有完全溶解,则电泳图像的背景将模糊。完全溶解的琼脂糖凝胶是透明的,并且锥形瓶的内壁上不应有琼脂糖颗粒粘附。
3.加热后,水蒸发。如有必要,应添加热蒸馏水以弥补原始重量并摇匀。
三、琼脂糖凝胶电泳
1. DNA条带模糊且拖尾。
(1)DNA降解。避免核酸酶污染。
(2)DNA负载过多。减少凝胶中DNA的负载量。
(3)过时的电泳缓冲液:多次使用电泳缓冲液后,离子强度降低,pH值升高,缓冲容量降低,影响电泳效果。建议经常更改运行缓冲区。
(4)电泳条件不合适。电泳时的电压不应超过20 V / cm,温度应低于30℃,巨大的DNA链应低于15℃。检查所使用的电泳缓冲液是否具有足够的缓冲能力。
(5)类DNA盐太高。游泳前,先用乙醇沉淀除去多余的盐。
(6)存在蛋白质污染。电泳前先提取蛋白质。
(7)DNA变性。电泳前无需加热,请用20 mM NaCl缓冲液稀释DNA。
2. DNA条带较弱或无DNA条带。
(1)DNA负载量不足:增加DNA负载量。
(2)DNA降解:避免DNA核酸酶污染。
(3)DNA脱离凝胶:缩短电泳时间,降低电压并增加凝胶浓度。
(4)具有相似分子大小的DNA条带不容易区分。增加电泳时间并使用正确的凝胶浓度。
(5)DNA变性:电泳前请勿在高温下加热DNA链。用20 mM NaCl缓冲液稀释DNA。
(6)DNA链很大,不适合常规的凝胶电泳。脉冲凝胶电泳分析。
3. DNAMARKER带变形。
(1)用于制备凝胶的缓冲液和电泳缓冲液不能同时制备。使用同时准备的缓冲液。电泳过程中,缓冲液应比液位高1?2 mm。
(2)电泳时电压过高。您可以在电泳前15分钟使用较低的电压(3 V / cm),并在条带从孔中出来后调整电压。
(3)尽可能缓慢地添加样品,并在样品自然沉降后施加电压。