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转录组测序知识介绍
Release Time：2019-11-07转录组测序是通过全面快速地获取某一物种特定组织或细胞在某一状态下转录出来的转录本序列，并与参考基因组比对，获得基因覆盖度和测序饱和度等，分析基因表达水平、差异表达基因、可变剪切、基因融合、基因结构优化、SNP、SSR、预测新转录本、细胞器基因及基因组的转录及表达水平、共表达网络等。针对人、动物、植物等模式生物，还可进行蛋白互作网络分析，深入研究基因功能，指导网络调控机制的进一步研究。
转录组项目：真核有参转录组、真核无参转录组、miRNA、cirRNA、LncRNA
我们可以免费二次筛选、可以与旧项目结合联合分析、数据再次挖掘价格减半。
1.1技术流程
1.2我们可以分析的内容：
基本分析：数据质控、参考基因组对比、转录本组装、测序文库整体质量评估。
数据评估：饱和度分析。
基因结构分析：新转录本预测、新转录本的功能注释、基因机构优化、可变剪切、CDS预测*、SNP分析、indel分析、SSR分析*。
基因表达分析：相关性分析、基因表达定量、重复相关性评估、差异表达基因筛选、差异表达基因聚类分析、差异表达基因韦恩图、差异表达基因功能注释、差异表达基因GO富集分析、差异表达基因KEGGE富集分析、蛋白互作网络分析。
个性化分析：转录因子预测、差异表达转录因子聚类分析、条件特异表达基因筛选、条件特异基因表达功能注释、基因共表达分析、融合基因分析、DEU分析。
细胞器基因及基因组的转录及表达水平分析：以核基因组和细胞器（叶绿体、线粒体）为参考，同时进行mapping，鉴定细胞器基因组的转录水平及表达差异以及RNA编辑位点。
共表达网络：基于WGCNA建立共表达网路，并深入挖掘并阐释与目标性状关联的网络。
1.3 部分结果展示
转录组项目：真核有参转录组、真核无参转录组、miRNA、cirRNA、LncRNA
我们可以免费二次筛选、可以与旧项目结合联合分析、数据再次挖掘价格减半。
1.1技术流程
1.2我们可以分析的内容：
基本分析：数据质控、参考基因组对比、转录本组装、测序文库整体质量评估。
数据评估：饱和度分析。
基因结构分析：新转录本预测、新转录本的功能注释、基因机构优化、可变剪切、CDS预测*、SNP分析、indel分析、SSR分析*。
基因表达分析：相关性分析、基因表达定量、重复相关性评估、差异表达基因筛选、差异表达基因聚类分析、差异表达基因韦恩图、差异表达基因功能注释、差异表达基因GO富集分析、差异表达基因KEGGE富集分析、蛋白互作网络分析。
个性化分析：转录因子预测、差异表达转录因子聚类分析、条件特异表达基因筛选、条件特异基因表达功能注释、基因共表达分析、融合基因分析、DEU分析。
细胞器基因及基因组的转录及表达水平分析：以核基因组和细胞器（叶绿体、线粒体）为参考，同时进行mapping，鉴定细胞器基因组的转录水平及表达差异以及RNA编辑位点。
共表达网络：基于WGCNA建立共表达网路，并深入挖掘并阐释与目标性状关联的网络。
1.3 部分结果展示
