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转录组基因检测知识分析
Release Time：2019-11-07一、有参转录组介绍：
转录组测序也称为RNA-Seq，通过全面快速地获取某一物种特定组织或细胞在某一状态下转录出来的转录本序列，并与参考基因组比对，获得基因覆盖度和测序饱和度等，分析基因表达水平、差异表达基因、可变剪切、基因融合、基因结构优化、SNP、SSR、预测新转录本、细胞器基因及基因组的转录及表达水平、共表达网络等。针对人、动物、植物等模式生物，还可进行蛋白互作网络分析，深入研究基因功能，指导网络调控机制的进一步研究。
RNA-广义范围对细胞里基因组的转录和表达，包括有mMNA、mi-RNA。RNA是和基因功能和结构去认识和了解，直接转为蛋白。
我们的优势：
无需预先针对已知序列可对任意物种的整体转录活动进行检测；可提供更精确的数字化信号，更高的检测通量以及更广泛的检测范围；可对低起始量或完整度低的样品进行文库构建；定制化的生物信息解读和分析。
可以与旧项目结合联合分析。
技术流程：
分析的类容：
饱和度分析、基因表达定量分析、基因差异分析、基因结构分析（新转录本预测、新转录本的功能注释、基因结构优化）、富集分析、相关性分析、可变剪切分析、SNP、INDEL、细胞器基因及基因组的转录及表达水平（以核基因组和细胞器（叶绿体、线粒体）为参考，同时进行mapping，鉴定细胞器基因组的转录水平及表达差异以及RNA编辑位点）、共表达网络（基于WGCNA建立共表达网路，并深入挖掘并阐释与目标性状关联的网络）。
