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染色质免疫共沉淀技术(ChIP)

Release Time:2020-07-14

一、染色质免疫共沉淀技术(ChIP)简介:
※ 染色质免疫沉淀技术(染色质免疫沉淀测试,CHIP)是目前研究体内DNA与蛋白质之间相互作用的唯一方法,其基本原理是将蛋白质-DNA复合物固定在活细胞状态,使其随机截面为一定长度内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀该复合物,以富集靶蛋白的结合,通过纯化和检测目标探针,确定的方式通过DNA片段获得有关蛋白质与DNA相互作用的信息。

二、染色质免疫共沉淀技术(ChIP)所需材料及试剂:
离心管、离心机、甲醛、甘氨酸、PBSSDS裂解缓冲液
三、染色质免疫共沉淀技术(ChIP步骤
A)将细胞的甲醛交联并超声处理。
1.取出一个平板电池(10厘米平板),添加243 ul 37%甲醛,以使甲醛的终浓度为1%(培养基为9ml)。
2. 37秒10分钟。
3.终止交联:加入甘氨酸至终浓度0.125M。在培养皿中加入450ul 2.5M甘氨酸。混合后,可以在室温下放置5分钟。
4.吸出培养基,并用冰冷的PBS洗涤细胞两次。
5.细胞刮板将细胞收集在15ml离心管中(PBS为5ml,3ml和3ml)。预冷却后,以2000 rpm收集细胞5分钟。
6.倒出上清液。根据细胞数量,添加SDS裂解缓冲液,由于最终细胞浓度为每200ul 2 x 106个细胞,每100ul溶液包含1 x 106个细胞,然后添加蛋白酶抑制剂复合物,假定MCF7杂草丛生的板为5×106个细胞,这次细胞生长到大约80%,即4×106个单元,因此,向每个试管中加入400ul SDS裂解缓冲液。将2管混合在一起,总共800ul。
7.超声波破碎:VCX750,25%功率,冲击4.5S,间隙9S 14次

四、染色质免疫共沉淀技术(ChIP)注意事项:
最重要的一点是抗体的性质,不同的抗体和抗原结合能力也不同,在IP反应中可能不使用无染料结合,一定要仔细检查抗体的使用说明书,尤其是多克隆抗体可能是问题所在;其次,注意溶解抗原的缓冲液的性质,大多数抗原是由细胞组成的蛋白质,尤其是骨架蛋白质,必须溶解缓冲液,否则,必须使用含有强表面活性剂的缓冲液,尽管它可能会影响某些抗原和抗体的结合。
另一方面,如果使用弱表面活性剂溶解细胞,将无法完全溶解细胞蛋白,甚至溶解也会产生与其他蛋白质结合的结果,该表位被封闭,这影响了与抗体的结合,即使IP成功,也是许多蛋白质和抗体沉在一起的悲剧性结果;第三,为了防止蛋白质分解和修饰,必须在抗原溶解缓冲液中加入蛋白质抑制剂,并在低温下进行实验,在每次实验之前,首先要考虑抗体/缓冲液的比例,太少不能检测到抗原,太多不能添加到珠子中,并且保留上清液,缓冲液太少将无法溶解抗原,如果缓冲液过多,抗原将被替换。

五、实验所需试剂清单:
1 1.5ml尖底连盖离心管                                                     F-EP015  
2 2ml圆底连盖离心管(灭菌)                                  F-EP020-H  
3 甘氨酸                                                                      SS3763  


 
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